超級計算機初次對原子進行逐個模擬

来源：米乐体育官方登录器    发布时间：2023-09-23 19:29:47

　　在左圖中，超級計算機模擬提醒了抗生素依維寧（淺藍色）怎么與細菌核糖體中的tRNA分子（金色）相互作用。右圖顯示，在沒有抗生素的情況下，不正確的tRNA（橙色）怎么進入核糖體。

　　科技日報北京9月21日電 （記者劉霞）美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室科學家初次使用超級計算機對原子進行逐個模擬，提醒了抗生素殺死細菌的細節，以及活細胞中其他分子機制的過程。這項研讨為改進抗生素功用、設計新抗生素對抗細菌耐藥性，以及開發針對新冠等病毒的疫苗開辟了新途徑。相關論文發表於最新一期《天然·通訊》雜志。

　　研讨團隊指出，信使核糖核酸（mRNA）的代碼攜帶著信息，可在細胞中產生特定蛋白質。核糖體通過從mRNA中讀替代碼來獲得遺傳信息。核糖體在分子信息表中查找代碼——一組被稱為轉移RNA（tRNA）的分子，用於選擇特定的氨基酸，並根據這些代碼指令制作蛋白質。

　　使用超級計算機有助於研讨人員更深入了解核糖體怎么讀取信使mRNA的代碼信息。研讨人員指出，約50%的抗生素會按捺核糖體的功用，這是一種有用的抗生素战略。為開發新抗生素，有必要了解核糖體在原子水平上是怎么作业的。為此，研讨小組模擬了核糖體和tRNA之間相互作用的分子動力學。

　　他們的模擬标明，不正確的tRNA分子在與核糖體相互作用時不會採用正確的幾何形狀，通過在這些模擬中引进抗生素慶大霉素、新霉素和潮霉素等，他們証明晰抗生素會影響tRNA的幾何形狀，導致核糖體摻入不正確的tRNA或根本不摻入。

　　研讨人員指出，核糖體是一切生命方式的中心信息處理分子機器，它必須破譯相關氨基酸的信息，哪些是正確的可接受的，哪些是錯誤的需求拒絕的，才干在細胞中構建蛋白質。凭借該實驗室的超級計算機，他們能夠逐個原子地對這一過程進行成像，並展现抗生素怎么影響這一過程，這對於應對將來或许出現的抗生素耐藥菌危機至關重要。

　　公民網上海9月21日電 （記者申佳平）初秋時節，黃浦江岸夜色旖旎。9月20日，來自政、產、學、媒的30余位嘉賓匯聚上海，共赴“公民之夜”沟通活動，暢聊數字經濟趨勢與才智城市發展。…

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